在临海老宾馆的惨剧发生之后，一支调查超自然现象的科研小组来到了这里。一名灵媒声称这个屋子非常危险，随后不久她就消失了，而一名队员也惨遭杀害，与此同时，一个全身包裹着绷带的神秘人出现了，他声称自己是这里的主人。谁也不知道这个神秘人是被一群魔偶从墓地中召唤回来的神秘亡灵，这是半个世纪前，源自开罗的一个承诺…… 　　更多精彩  尽在夜半子不语论坛

年轻的科学家塞斯（杰夫?高布伦 Jeff Goldblum 饰）刚刚发明一台能传送物体的“电动传送机”，这台机器能将物体分解，传送完成后再自动合成还原。兴奋不已的塞斯决定亲自体验一下电动传送，于是，他进入了传送仓。不幸的是，一只苍蝇这时也飞进了传送仓，于是，在机器将分解 后的塞斯的分子再合成时，将苍蝇的分子也合成到了塞斯的体内。塞斯成了拥有一半苍蝇基因的蝇人。 　　起初，塞斯的身体就像蜘蛛侠一样变得强壮和精力旺盛，他的女友维罗尼卡（吉娜?戴维斯 Geena Davis 饰）根本不相信男友的鬼话。但是，随着塞斯的身体迅速的渐渐老去，身体开始长毛，牙齿脱落，浑身冒浆，维罗尼卡渐渐接受了这个事实。她并没有遗弃男友，而是和他一起平静的接受了这个事实，即使他变得血肉模糊，她还是和他一起相拥而眠。

这部拍摄于1989年版的《变蝇人2》是1986年版《变蝇人》的续集，影片承接第一集母亲维尼卡怀上赛斯孩子的伏笔，当她产下一枚蝇蛹时被当场吓死。当局的科研机关巴托工业园收养了苍蝇之子马丁·布朗多（艾瑞克·斯托罗兹 Eric Stoltz饰），由巴托工业的老总巴托先生（约翰·盖兹 John Getz饰）抚养。巴托先生密切监视着马丁的一举一动，表面上把马丁视如己出，实则却把他当作研究对象，暗地里用摄像机记录下他所有的生活过程，让马丁研究他父亲生前的时空传送装置。马丁看上去英俊帅气，无异于常人，除了的惊人的生长速度和超人的天资才能。不久，马丁就与美丽的贝斯·洛根（达芙妮·祖尼加 Daphne Zuniga饰）坠入爱河。可隐藏在马丁体内的变异染色体突然苏醒，等待马丁的是变成下一个“苍蝇人”的恐怖噩耗。

2013年，肖恩·米勒失踪了四天。七年后，一群纪录片制作人开始寻找失踪原因。

一名宇航员返回地球后坠毁在一片田野里，受到严重辐射，造成了严重破坏。就在他们把他逼到绝境时，他却消失了，“真正的”宇航员在7500英里外的太平洋被发现，“还活着，身体健康，体型正常”。

某医学博士在派对上被一名透明人杀死，探员特纳（彼得•费辛利 Peter Facinelli 饰）与丽萨在勘察现场时却被告知此案由国防部接手，而他二人的任务是保护女生物学家道尔顿（劳拉•里根 Laura Regan 饰）。另一方面，透明人在杀死医学博士前，得知令自己身体好转的缓冲药剂只有道尔顿才能提供……

僵尸侵染的范围持续扩大之余，人类也加紧进行针对性研究。研究员莎拉（Lori Cardille 饰）和直升机驾驶员约翰等人空降到矿道改建的地下研究中心，罗根医生在这里研究僵尸习性，并得到了一些初步成果。负责中心安全与捕捉僵尸的军人们对暗无天日的地下生活早已厌倦，每天面对同袍死去、消息隔绝、研究进展缓慢让他们暴躁易怒，并在长官罗德（Joseph Pilato 饰）带领下公然反抗项目负责人。精神濒临崩溃的士兵米格尔因僵尸啮咬失去一臂，同时军人与研究人员的矛盾全面爆发，罗德凶相毕露，将莎拉等人赶入满布僵尸的坑道，米格尔则将僵尸放入中心，失控的局势中，莎拉等人全力求生……