这是一部描绘非线型历史的神话故事。人类大战持续了将近50年，世界由此分化为大亚细亚连邦共和国和欧共体两大阵营。持久战结束后，大亚细亚连邦共和国终于取得了胜利，并统治了欧洲和亚洲部分大陆，但战利品并不可观，除了土地的荒废，人心的慌乱外，还残留了很多战争后遗症。比如一些在战场上使用过的杀伤性化学武器、细菌武器、核武器等等。这一情形告诉我们拯救人类、拯救社会、拯救世界刻不容缓，人类处于即将崩溃的状态。怎样去面对这一切？怎样去寻找重生的道路？社会呼唤有志之士勇敢地战出来给这个被战争荒废了世界寻找一个公道。在这样危急的时刻，东博士提倡“完整地制造出人类所有器官的新造细胞”理论，这一理论在学术会上得到了认可。东博士的爱妻绿已久病卧床不起，为了把妻子从死神手中夺回来，东博士也必须完成这个研究。但社会保健部门从研究初期开始就企图独吞这一成果，为了顾全大局东博士在不断让步的情况下，着手开始这项研究。在东博士的呕心沥血的研究下，新造人类终于诞生。但原本是以拯救人类为目的制造的“新造细胞”到头来却于人类为敌，把人类赶进血的世界……

明治45年，新日本进入高速发展时代。实业家涉泽荣一（勝新太郎 饰）请来阴阳师平井保昌（平幹二朗 饰）以及物理学家寺田寅彦（寺泉憲 饰），请求他们安抚因叛乱而被杀的平将门的怨灵，并借助这股灵力推行“东京改造计划”，试图自此建立一个武备完全的军事帝都。然而神秘的魔人保宪（嶋田久作 饰）却扰乱了涉泽的计划，他企图唤醒平将门的怨灵，进而摧毁东京。为达目的，加藤找到平将门的后裔——美丽的少女辰宮由佳理（姿晴香 饰）充当灵媒。一时间阴风阵阵，愁云密布，东京危在旦夕。为了保护帝都，上至军人政客，下至作家文豪纷纷行动起来…… 　　本片根据荒俣宏同名原著小说的1~4卷改编。

在医院工作的山际辰雄（染谷将太 饰）和悦子（夏帆 饰）是一对恩爱的小夫妻。近一段时间，辰雄时常望着窗外发愣，令妻子分外不安。与此同时，悦子所在的工厂同事浅川美雪（岸井雪乃 饰）出现异样，她声称总在家中看到男性幽灵，但那却是她在世的亲生父亲。悦子将美雪送到丈夫的医院检查，结果发现美雪完全丧失了“家人”的概念。在医院时，悦子还遇到了辰雄的好友真壁医生（东出昌大 饰），而对方给她留下了十分不好的感受。渐渐她发现，辰雄与真壁之间似乎有着某种联系，两人更秘密在进行着什么。

沙魯奈公主乘機前往日本途中，飛機突然爆炸，唯公主一人得以生存並降落地球，可是其意識轉為有預言能力的金星人，這金星人的使命就是要拯救將要滅亡的地球，金星的文化科學被宇宙怪獸 奇古度拉破壞淨盡，奇古度拉的下一目標就是地球，可是地球怪獸哥斯拉跟拿頓卻互相仇恨，並沒有助人類的打算，魔斯拉唯有出動苦勸，望說服牠兩對抗奇古度拉。

2010年秋，世卫组织官员小林荣子（檀丽 Rei Dan 饰）随队前往菲律宾扑灭禽流感，疫情很快得以控制，但仍有感染者私自离开疫区……次年，东京都的某家市立医院，医生松冈刚（妻夫木聪 Satoshi Tsumabuki 饰）收治的一名高烧病人入院后情况急转直下，咳血而死，病人家属与部分医生亦因感染而病倒。同时，近郊一家养 鸡场内检测出禽流感病毒，场主神苍及女儿（池肋千鹤 Chizuru Ikewaki 饰）的平静生活被打破。
小林荣子受命至此指导防疫，旧相识松冈担任其助手。疫情迅速扩散，一月之内病亡人数达到两千，各地出现恐慌，引发国际关注，政府迅速将疫区封锁。松冈偶然之下得知病毒源头可能另有所在，国外传回的检测结果支持了他的判断，松冈决定远赴国外查找病源。在空前的疫情中，松冈、小林以及神苍每个人都将面临自己选择的考验

日本特摄首次真正的彩色科幻电影。冈本太郎设计的派拉人大放异彩。在世界各地UFO的目击成为话题的时候，在东京天文台的助手矶边发现了谜一样的发光体。在进行研究的过程中，不久海星型的宇宙人·派拉人开始出没。派拉人们告诉我们，天体正在接近地球……

宇宙世纪0079年，地球联邦与吉翁公国一年战争结束时，Side 4宇宙殖民地群摩尔被吉翁军摧毁，许多居民丧生。在黑暗区域，无数被摧毁的殖民地残骸和沉没的战舰漂浮在周围，由于碰撞和带电碎片而不断闪烁闪电，不知不觉中，该区域已被称为“雷电区域”。塔。摩尔兄弟会是由摩尔公民的幸存者组成的地球联邦军的一个单位，渴望夺回他们的家园雷电星区，并寻求消灭该星区的吉翁军。吉翁军为了阻止联邦的前进，还部署了为了收集假肢士兵的战斗数据而成立的活死人部队。属于摩尔兄弟会但讨厌被家乡和出身束缚的伊奥·弗莱明和在过去的战斗中失去双腿、现在在活死人分部担任王牌狙击手的达里尔·洛伦兹在这场比赛中相遇。战场上，他们认识了彼此。两人是注定要互相残杀的……

一位普通白领青年（田口智朗饰）在地铁站被手上有着铁爪的神秘女人（叶冈伸饰）袭击追杀。一番打斗后返家，他在色情幻想中发现自己的身体竟正在钢铁化，下身变为巨大的钻头，拥有了极其可怕的力量，他的女友（藤原京饰）成为了变身的祭品，而他最终变为一个金属的怪物。 　　这时来历不明的男子（冢本晋也饰）出现，原来他在青年造成的车祸中大难不死，并因此获得超能力，他的憎恨力量导致了以上所有事情的发生。一个由钢铁打造的躯体，一个神秘的超能力者，他们将展开可怕的对决。

最大的看点无疑是三大男主角超越电视剧界限的梦幻合作！ Blue Beet 和 B-Fighter Kabuto 出现，帮助 Kabutack 摆脱困境，并召集了所有之前的甲虫机器人！另一大看点是从未在电视上播出过的A-Robo军团！高圆寺教授的前对手津田沼教授为对抗蜜蜂机器人而制造的 A-Robo，与 Kabutack 和蜜蜂机器人联军之间展开了一场决定性的战斗！除了饰演圣诞老人的藤谷富美子之外，《Jetman》中的岸田理香（白天鹅）和内田小百合（蓝燕子）、《B-Fighter》中的土屋大辅（Blue Beat）、《B-Fighter Kabuto》中的中里荣一郎（Kabuto）也将作为特邀嘉宾登场！这个超豪华版挤满了只有在 OV 中才可能出现的激烈战斗，以及你在电视上永远看不到的精彩场面！

在与艾奥的殊死战斗中获胜后，达里尔作为吉恩残余部队的一员来到地球。他正在执行一项情报任务，以获取有关被盗的 Psycho Zaku 的信息。与此同时，当艾欧和她的新战友们一起参加雷霆行动时，她遇到了自称是南海联盟边境警卫队指挥官的中校佩尔。吉恩、联邦、南海联盟三方的机动战士战斗在海底、冰原、丛林中展开。战争尚未结束。