恐怖组织“瓦干布”渗透香港，在香港掀起一场化武争夺战，飞虎队总指挥范少锋（陈豪 饰）临危受命，率飞虎队与恐怖分子斗智斗勇。飞虎队身陷瓦干布的无情杀局，特勤队警司展博文（马德钟 饰）召集警界精英张伟桦（张兆辉 饰）、张嘉轩（黄宗泽 饰）和高子乐（吴卓羲 饰）成立秘密反恐小组S Team。面对重重危机，在国际刑警许俊飞（苗侨伟 饰）的协助下，中青两代最终放下恩怨情仇，联手阻止化武病毒在香港蔓延。

法政先锋们的故事还在继续，这次的主角是法证部的高级化验师布国栋（黎耀祥 饰）。号称“人肉百科全书”的国栋知识渊博，且一直不断学习，他与法医科高级医生钟学心（张可颐 饰）既是事业上的伙伴，又是生活中的好友，共同研究工作上的疑难杂事，又互相倾诉生活中的困扰。学心的好友凌倩儿（徐子珊 饰）任职于西龙九重案组，作为高级督察的她，身手了得，和警长李展风（吴卓羲 饰）是好拍档。法医部、警界等因为各类案件而经常需要合作，而正是在他们的联努力下，一起起棘手的案件被侦破。                                                                      　　布国栋和妻子周奕霏（胡定欣 饰）因为观念不和，最终以离婚收场，而他与学心的感情也与日俱增，学心童年悲惨的经历让他们把目光投向了新的案件上……

第二部里，张大勇（陶大宇饰）与李忠义这对默契排档继续与狡猾凶狠的罪犯斗智斗勇。感情方面，大勇与高婕（郭可盈饰）成为斗嘴情侣，感情稳定增长。新来的女警员蓝嘉文（郭霭明饰）单纯善良，暗恋大勇并主动示爱。令大勇和高婕的问题出现新的危机。此时，高婕发现嘉文过去曾在外国因为三角恋而放火杀人，正当要揭发这一段过去时，高婕的朋友离奇被杀。嘉文对过去的矢口否认也不像假装，大勇与高婕的误会加剧，事情的真相扑朔迷离。

廉署首席調查主任江見秋，在上市公司貪污案以準母親身份接近關鍵人物，找到破案缺口。總調查主任司徒啓文，在調查維修招標案中帶著助理調查主任丁芯假裝成父女買樓，並在槍隊成員徐浩南與助理調查主任鍾巧玲幫助下，成功遊說關鍵人物蒐集涉事建築公司的罪證。高級調查主任伍學賓，透過IT知識找出獄中是誰與外界溝通的痕跡，成功偵破懲教人員貪污案。即使巧玲與丁芯對中學工程貪污案涉案人物的判斷不同，二人甚至在保險行賄案因認識涉案人物而被停止接觸案件，強烈正義感與使命感無阻二人向著找出真相的目標進發。

乔星（陈豪饰）、阎武（黎耀祥饰），一个是如日中天的神级杀手，一个是风光不再的潦倒杀手。两人却有着共同的敌人，联手复仇令他们结下不解之缘。 “杀手猎人”的出现却威胁著整个杀手界。杀手、清道夫、经理人悉数出手拆解危局。杀手界外的单亲妈妈向茜（李佳芯饰）、一楼一凤姐淑娴（江美仪饰），也因与乔星、阎武的感情被卷入危机……乔星为解决杀手猎人，竟导致阎武之女重伤昏迷。阎武为向女儿交代，必须杀乔星；乔星为了向茜，必须活下去。两代杀手之王，最终走向了没有退路的对决……

督察戴安娜（宣萱 饰）一直安逸于档案管理的后勤岗位，因缘际会跟元祖级陀枪师姐陈三元（滕丽名 饰）、飞虎队男神蒙汉森（陈豪 饰）合力破案后，被上司韦展超（许绍雄 饰）安排加入悬案小组，与一班各有「特色」的警员，在汉森带领下追查外界不关注的悬案。汉森不满安娜而互相斗法，直至揭露安娜因曾被胁持而恐惧用枪，反令二人擦出爱火花！安娜重遇多年前惨遭灭门的补习学生刘达华（罗子溢 饰），他却加入了黑道……在感情与内疚推动下，安娜能否拿回手枪重新振作，成就新一代的「陀枪师姐」？

法政先锋们的故事还在继续，这次的主角是法证部的高级化验师布国栋（黎耀祥 饰）。号称“人肉百科全书”的国栋知识渊博，且一直不断学习，他与法医科高级医生钟学心（张可颐 饰）既是事业上的伙伴，又是生活中的好友，共同研究工作上的疑难杂事，又互相倾诉生活中的困扰。学心的好友凌倩儿（徐子珊 饰）任职于西龙九重案组，作为高级督察的她，身手了得，和警长李展风（吴卓羲 饰）是好拍档。法医部、警界等因为各类案件而经常需要合作，而正是在他们的联努力下，一起起棘手的案件被侦破。