空中响起奇怪的声音，人们一个接一个地倒下，并最终消失。出现在前往调查的精英部队GUTS-SELECT队员们面前的是，一波波来袭的外星人军团，以及驾驶着漆黑要赛艇“佐尔加乌斯”的支配者基贝尔斯教授，它妄图扭曲地球的天空。

封印不死兽后4年，剑崎等人过上平凡人的生活。但在某天，不死兽再次出现，而且要活捉天音，假面骑士们因此重新投入战斗……

因诽谤罪被捕的座头市，被因无罪被判处死刑的黑道岛三送进监狱，为的是给他一个弟弟黑间千八或荒井的老大十兵卫，以证明自己的清白。他让我去拜访他。第二天早上，一离开监狱，加入了年轻的黑帮百太郎，但一一脱下草鞋，前往青田的釜树，与一一有着深厚的渊源，受到了无与伦比的款待，并与这座城市分道扬镳。几天后，一在大洗的一家旅馆拜访了黑间千八，向他讲述了岛三的情况，并请求他的合作。千八一度接受了这一点，但那天晚上，黑间家族在睡梦中袭击了他。一以自己的专长居合紫里击败了刺客，并得知是荒矶十兵卫贿赂了政府官员并制服了岛藏，并救出了黑间家族的人。女人奥梅.从那以后，青梅就很喜欢一，再也不想离开。此后的几天里，一都被伪装成百太郎的假座头市所困扰，但出于对岛三安全的担心，他匆忙前往荒矶的十兵卫。当时，岛仓的女儿Ochiyo绝望地请求十兵卫以某种方式拯救岛仓。然而，十兵卫却利用了十代的弱点，试图窃取她的身体。然而，千钧一发之际，一却用致命的“Gyakuteziri”击败了十兵卫的心腹，并迫使十兵卫写了一封证明岛三清白的信。在那里，一从太千代那里得知百太郎是岛藏的儿子。市政府立即将十兵卫的信转交给了被关押在刑场的岛仓。在岛三因被证明无罪而流下喜悦的泪水后，这座城市的孤独形象消失在鹿岛海的沙丘中。紧随其后的是拼命追赶的大米……

宽永十五年，德川幕府打压天主教徒，导致爆发血腥残酷的岛原之乱。在这起事件中，约有两万名天主教徒惨遭杀害。及至深夜，满怀巨大仇恨的教众首领天草四郎时贞（沢田研二 饰）复活，他捐弃信仰，转生魔界，发誓报复幕府统治者。在此之后，他接连将细川夫人（佳那晃子 饰）的怨灵、濒临寿终却心存遗憾的宫本武藏（緒形拳 饰）以及宝藏院胤舜（室田日出男 饰）、遭遇灭族的伊贺忍者雾丸（真田広之 饰）拉入魔界，邪魔的力量陡然倍增。细川化身阿玉迷惑四代将军家纲（松橋登 饰），柳生但马守宗矩（若山富三郎 饰）有心除魔，无奈天不假年，更在弥留之际堕入魔道。柳生十兵卫（千葉真一 饰）成为铲除邪魔外道的最后希望……

2002年10月19日，专事袭击犯罪交易现场获取高额赃款的宫本（金城武 饰），在一次行动中发现参与交易的一方居然是自己的仇敌沟口（岸谷五郎 饰），宫本的故人昔日被沟口所杀，正欲复仇的宫本却被一个突然出现的少女美里（铃木杏 饰）打乱了步骤，只得听任沟口逃离。美里自称是来自2084年的未来人。未来的世界遭到外星人袭击，躲避在西藏的幸存人类试图运用失控转移器将里美输送到2002年来改变历史拯救人类。里美的任务只剩两天时间，只好请求宫本协助她拯救世界。宫本对里美的故事嗤之以鼻，他首先要解决的敌人是有着三合会背景的沟口，然而在里美的威逼之下，宫本只好扮演起救世主…

地球之所以有今天的和平与繁荣，全靠那些默默无闻的超级战队牺牲小我，权力对抗接二连三入侵的宇宙怪人。但是最近一批战队成员服役期满，于是有些不着调的司令官查尔斯（佐藤二朗 饰）出于根本没有说服力的理由找到了兢兢业业的建筑公司OL赤木直子（桐谷美玲 饰）、强势的服装店店员青田美佳（藤井美菜 饰）、为钱所困的贫乏女黄川田由里（高畑充希 饰）、在小剧团编制演员梦想的绿川佳乃子（有村架纯 饰）以及挑男人眼光极差的白富美绀野菫（山本美月 饰）。为了地球的和平，五个人勉强组队，但是在怪人入侵的过程中，女孩们却总是因各种琐事请假缺席，而她们似乎也有了越来越多不用奉献那么多义务的借口。