阿娟（大昕 配音）的父母在大城市打工养家，他留守在故乡，因为孱弱的体格和怯懦的性格常常遭到旁人的欺负。一次偶然中，阿娟邂逅了和自己同名的舞狮少女（秋木 配音），少女飒爽的英姿和如雷贯耳的话语激起了阿娟对舞狮这项传动活动的兴趣，他打算参加舞狮大赛来证明自己的能力，很快，阿娟的好友阿猫（大雄 配音）和阿狗（郭浩 配音）也加入了这个计划之中。

麦兜，一个长得不帅，头脑平平的小朋友。和妈妈麦太太，在香港一个叫大角咀的地方过着并不富裕却很快乐的生活。从麦兜带着妈妈的期望来到世界那一刻开始，他的脑海中一直飘满七彩幻想的泡泡。那个蓝天白云，椰林树影，水清沙白的童年的马尔代夫，那充满诱惑的圣诞火鸡的浓香，还有那个关于“抢包山”的奥运金牌的梦想，让麦兜平凡着他的平凡，却幸福着他的幸福。麦兜，和春田花花幼儿园的小朋友们一起，陪着我们，简单的在爱的呵护下慢慢长大。

在一个月黑风高的夜晚，灰太狼（张琳 配音）和一众同伴相约，杀进羊村捕捉小肥羊，为老婆和孩子送上情人节的饕餮大宴——涮羊锅。与此同时，羊村正在举行大白菜成功培育一千周年的庆典，节日的欢乐气氛却被突如其来的灰太狼所破坏。正当灰太狼与喜羊羊（祖丽晴 配音）激战正酣之际，狂暴骄纵的虎威太岁（贾译 配音）率领众多手下来到羊村，扬言要在这里修建游乐场。转眼之间一座豪华的游乐场拔地而起，小肥羊们被迫沦为这里的工人，连高傲自大的灰太狼也难以幸免。面对这个突如其来的虎威太岁，羊羊和灰太狼被迫联手……

奇门派和五毒派为江湖两大门派。两大门派为了“皇家龙种花落谁家”而各施其法，误打误撞地揭发了企图让皇帝（陈浩民饰）得不到子嗣而待其驾崩后坐上皇位的皇叔的阴谋。皇叔派出潜伏在皇后（胡然）身边的五毒派弟子秀明（甄淇饰）试图毒害皇嗣，而秀明却阴险狡猾另有企图，对皇叔并不忠心，趁机为己谋私利。反而奇门派的多美（邱意浓饰），为人善良，大大咧咧，总是乐从天降，化险为夷，更对权势亳不留恋，倾心于英俊勇猛的萌笨直男侍卫太阳（何浩文饰），二人合力化解皇叔之乱，不恋名利，欢天喜地浪迹天涯。

随着城市发展，麦兜住的旧区大脚咀也卷入了拆迁漩涡。不过无忧无虑的麦兜从来不会去考虑拆迁对他意味着什么，春田花花幼稚园又开学了。为了适应激烈的社会竞争，春天花花幼稚园也加入很多令人捧腹的新课程：耍赖、诈死等等。麦太在樟木头买了块墓地，为了日后能有个安身之所。时光飞逝，一切又回到了从前，回到了麦兜的父亲菠萝油王子的时代。王子跟随着师傅出行，不料遇到了一连串怪事，王子不再是王子，有人变成了他的样子回去当了王子。浑浑噩噩的菠萝油认识了阿莲——以后的麦太，过着平平凡凡、庸庸碌碌的生活，只是在夜里，菠萝油偶然会想起他的王国、眼里会呛着泪花。阿莲怀孕了，菠萝油重遇了以前送薄饼的龟仔、一起出行的师傅，他们决定回去复国了。于是菠萝油告别了阿莲，告诉他如果明天听不到一个王子复国的新闻，那就永远忘了他…

本片是《麦兜故事》系列的第三部，由现实和动画两部分故事组成。