高中女孩吉冈双叶（本田翼 饰）刻意让自己显得不修边幅，以避免成为其他女生攻击的对象，每天都不得不为此小心应付，殚精竭虑。某天，她意外重逢了曾在初中时代有过交集的男孩田中洸（东出昌大 饰）。当初田中搬家到了长崎，此番重逢后不仅将姓改成了马渕，性格似乎也发生巨大的变化。以班级活动为契机，双叶、马渕、马渕的好友小凑亚耶（吉泽亮 饰）、特立独行的高冷女村尾修子（新川优爱 饰）以及因过于可爱而遭到孤立的槙田悠里（藤本泉 饰）聚到了一起。原本他们的情感便彼此交错，而隔壁班的天才帅哥菊池冬马（千叶雄大 饰）、教师田中阳一（小柳友 饰）以及马渕在长崎的旧友成海唯（高畑充希 饰）又让男孩女孩们的关系更为复杂，于是平添了无数的烦恼……

平静的日子里，在黑泽的家中，橘梅（茅野爱衣 配音）和黒泽大和（樱井孝宏 配音）的母亲（小林优 饰）一同做饭，气氛极其温暖融洽。与此同时，大和来到街头打发无聊时光，刚好接到一条来自好友竹村海（前野智昭 配音）的短信，他应邀前往以前两人最常去的公园，二人回忆往事，心中感慨万千。下一个镜头，某个车站，美丽的北川惠（寿美菜子 饰）站在车站前。一辆公车驶来，竹村海发现惠，于是下了车自顾自坐在她的旁边与之聊天，谁知却最终惹恼了对方，别扭的情感，说不出的话语……

故事始于2046年，为了追捕侵袭火星的外星人多鲁米斯星人，宇宙探索舰Lysithea号在各地挑选先发人员，初中生美加子（武藤寿美配）也成为一名宇宙员。开始了辗转于火星、太空基地、木星、冥王星等各地的演习。美加子离开地球后，她的同班同学小昇（铃木千寻配）仍然能收到来自宇 宙的问候——美加子时常发来短信告知近况，只是随着距离的扩大，短信送达地球的时间就会越来越长。“有一天一定能再见面吧！”对方都这么想着。可是，美加子终于杳无音信了。
8年后，小昇在报纸上读到了8年前宇宙军和多鲁米斯星人恶战且几乎无人生还的新闻。此时手机突然响了：“24岁的小昇你好，我是15岁的美加子哦！……”手机屏幕上映出这样的话来。