刚过21岁生日的大福（文章 饰）是个孤独症患者，父亲王心诚（李连杰 饰）在妻子去世后，一个人将大福养大，如今王心诚身患肝癌，自感时日无多，虽然楼下开小卖店的柴姨（朱媛媛 饰）时常给这对父子无私的帮助，但如何安置大福的未来还是王心诚放不下的牵挂，他甚至有了和儿子一同赴死的想法。王心诚试图将大福送回培智学校，但是学校、福利院一连串的拒绝令他倍感失落。而且在大福的世界里，水是他最好的朋友，这个能像海豚一样畅游的孤独症患者也无法离开水族馆，在水族馆，大福结识了善良的杂技女子玲玲（桂纶镁 饰），而王心诚急于教会大福生存的技巧，他的时间已经不多了……

本剧将延续《家有爹娘》第一部的整体风格，继续讲述王家三世同堂的情感故事。该剧以贴近百姓生活、反映当下社会现状，展示普通人婚姻状况和家庭情感的现实生活为出发点，通过表现价值观念与生活背景迥异的两代人对生活各自不同的态度，显示出极强的现实意义。王家二媳妇田一的怀孕重新点燃了王起孟（张炬饰）抱孙子的希望，全家人为小生命的到来积极做着准备，然而两代人对怀孕的不同想法也造成了不少误会。随着一个漂亮孙女的诞生，王起孟却郁闷得病倒了……侯淑云（严敏求饰）和王起孟商量，想让前大儿媳刘颖、孙女兰兰、外孙女小桃早日结婚，为他们生个男孩续接香火。英俊洒脱、才华出众的服装设计师王学兵（张智尧饰）欣赏公司女老板刘颖（朱琳饰）的气质和美丽，穷追刘颖。刘颖犹豫再三，终于鼓起勇气接受这份难得的爱情。当他们就要宣布结婚时，刘颖却发现自己的女儿兰兰一直暗恋王学兵。母女俩爱上同一个男人，令她们陷入感情的痛苦煎熬中，也让王家上下闹翻了天。经过一段时间痛苦的折磨，兰兰和刘颖都把对方的幸福看成是自己最大的幸福，刘颖拒绝了王学兵的爱情，兰兰则决定同男友秦海订婚。在兰兰和秦海的订婚仪式上，王起孟兴奋地催兰兰快要孩子，可是秦海却回答他不想要孩子…义。