工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！
很久以前，无人居住的山里建立有人类最新的研究中心 某日，研究用的main computer突然拥有自己的意识而暴走，人类费尽千辛万苦阻止了暴走，取回了和平……看起来是这样的 回到和平生活的人们，为了预防敌人再次暴走袭来，而准备了巨大萝卜，并选出战士们进行训练，某日，这一天终于来临了 站在袭来的敌人们面前的队伍，就是特命战队Go Buster！！ 他们的战斗，现在开始！
「我照样第一次看到，有人能将浮游邪术使得云云支放自若。」「那一面也没有容易，只是人人皆出实验过而已。」占有现代社会无奈权衡的超规格邪术手艺，却连结谦真态度死涯的青年‧亚连，正在恩师的委托下，以家庭先生的因素前去指面『用没有了邪术』的公爵千金‧蒂娜。里临那名已被有数人抛却的少女，没有盘算铁心的亚连所教授的课程是──「便我小我私家以为，邪术并没有是人类以操控魔力的体式格局施放，而是背细灵借用气力而已。」亚连的邪术课程内容推翻了知识。正在谆谆擅诱后，亚连解开了启印正在蒂娜身上的谜团，而那也是背天下掀起革命的师徒传讲劈头！
城市中出现了来历不明的光病毒。 SRC中的Eyes队成员为要确认光源搜寻至镝矢岛，遇上了对怪兽充满爱心的预备飞行员春野武藏。此时，光病毒入侵怪兽力特里亚斯体内，力失控，Eyes准备向力发动攻击，武藏决要阻止，危急中，超人高斯终于回来。
