本季延续《西行纪》前一季剧情，讲述了唐三藏与师徒四人取得奇经交予天宫的十六年后，为了心中正义，再次集结成“西行小队”，重新踏上“还经”之路的故事。
“武”是指道义，“拳”并不是指拳头，而是握紧的希望！这个世界上所有人都在锤炼自身的能量“武魂”，以双手作为媒介而附上自身的灵魂，从而进行征战，这群人被取名为“武拳师”！这是一个关于武拳师英武向命运抗争，对抗邪恶的王道少年热血故事。
茶神茶婆婆、太湖渔神渔婆婆和太湖蚕花神蚕婆婆给故事中的少年阿太讲故事的方式，为观众们带来了36个生动有趣的江南民间故事。该片将中国传统文化与江南三大民俗要素（茶渔蚕）自然地融入到故事情节中，让大朋友和小朋友们在活泼有趣的故事中认识到人与人之间的多样性并学会包容和尊重他人，同时也建立起他们与传统文化之间、与地缘文化之间的链接。爱家乡，知其源，懂其理。讲好太湖民间故事，讲好江南民间故事，小而美地传递正能量，就是讲好中国故事。
击败终极歼灭者后，海阳博士为帮助众人返回现世空间而启动聚核基因石，却不慎引起能量爆炸。爆炸的基因石碎片进入了不同的空间缝隙，引起空间缝隙能量失衡，导致大量时空异常现象出现。为避免时空交错，引发空间混乱，海澄与变形联盟四位成员开始寻找并修复出现的空间缝隙。而另一边，浩肯星一方也派出精锐部队来到地球，旨在抢夺基因石碎片能量，消灭变形联盟。面对修复空间缝隙的艰巨任务，面对来自浩肯星的新的敌人和威胁，海澄和变形联盟成员毫不退缩，全力以赴。他们凭着过人的机智，同伴间的信赖，以及面对强敌的勇敢无惧，粉碎了敌人的一系列行动计划，击倒了强大的对手，最终守护了时空的平衡与地球的和平。
正魔大战已过去十年，张小凡化身鬼厉，在魔教内斗中征伐四方。此时死亡沼泽异宝出世，引得各方势力争夺，鬼厉与陆雪琪重逢，两人陷入了更深的爱恨纠葛。后鬼厉因下属失踪一事追查至焚香谷，意外救出九尾天狐小白，获得古巫族线索，最终鬼厉在历经九死一生后，终求得掌握招魂奇术的大巫师答应前往救治碧瑶，十年夙愿，究竟结果如何……
