故事发生在天保14年的江户。当时在老中?水野忠邦实施的财政紧缩政策之下的老百姓生活在极度困扃中。国内government的压迫，加上外国殖民者入侵的威胁，在江户的大街小巷中弥漫着一种不安的气氛。在不为世人所知的地下，存在着一个秘密的神社。这个神社表面上对外称是对外国传入的学术文化进行研究调查的『蛮社改所』，而实际上则是专门对付各国潜入日本的『妖夷』，并负责将他们秘密抹杀的government隐蔽机关。该组织的头目名为小笠原放三郎，是个醉心于“兰学”，并极力证明其实用性的学者。然而却不得不听从南町奉行?鸟居耀藏的差遣。小笠原虽然没有了得的身手，但却与有着能将汉字中蕴藏的不可思议力量“汉神”诱导而出并具现化的高超能力的“妖奇士”龙导往压等人承担着暗中保护江户的职责...
供职于西德艾斯勒纪念医院的日本人天马贤三被人称作“天才医生”，他的外科技术精湛，为人谦和，受到同事的羡慕和医患的敬仰。事业上，天马前途一片光明，为院长所看好；爱情上，院长的女儿爱娃与之相恋，如胶似漆。然而看似一切美好的天马却渐渐感到良心上的不安，他亲眼目睹院方为抢救重要人物而置病危的普通人于不顾，死者家属的指责和哭泣让天马备受煎熬。当这种两难抉择再一次到来之时，天马毅然选择抢救一个头部中枪的男孩。他牺牲了自己的事业和爱情，却换来一个可怕怪物的复活。在接下来的岁月里，天马和怪物约翰展开了斗智斗勇的游戏，一段尘封的历史慢慢被揭开……
故事讲述的是在关东大沙漠那样的一片死亡之地上，数百年前，繁荣的文明毁于一旦，只留下沙海中默默矗立的高楼废墟，如墓碑般渲染着浓重的死亡气息。这里白天温度超过 50摄氏度，到了夜晚又骤降到零下，环境极其恶劣。即使在这种地狱般的世界里，仍然活动着顽强的人类。 在那里为了赚钱从看厕所到杀人什么都肯干的叫便利屋的职业大为受人欢迎,在这其中,有一位有点名声,为了完成任务可使用任何手段,集卑鄙,恶劣于一身,并不堪女色,抠门的男人。这个男人使用一把古老的霰弹枪,人们称他为砂和尚。这个被称作“砂和尚”的少年，他原名水野灌太，对沙漠了如指掌的他在这里干着代理人的工作，为了生存以及完成任务不择手段，和他在一起的助手则是被称作“小沙”的女孩小泉太湖。在充满危险的大沙漠里，展开了一个残酷的生存故事 。
