这个世界存在着一种被称为“魔女”的人，她们隐藏自己的力量，在世界上平静安逸地生活着。她们有着自己独特的联络方式，偶尔召开一些会议，喝喝茶，赏赏花。倾听着地球的声音，了解自然的她们，为了想要融入人类的生活而在世界上团结努力地生活着。 由于长年累月过着人类的平凡生活，现在魔女的子孙们渐渐失去了魔法的力量。大多数魔女却非常高兴，因为在人间社会要是拥有“特异”的力量会招来什么样结果，大家都很清楚。但是好景不长，平和的日子终于被打破了…… 被魔女们称为圣地的地方笼罩着瘴气，那其实是增加魔女们魔力的秘密媒介。生活在人间的魔女们，认为无用的力（魔法）只不过是一种绊脚石罢了，因此将它封印了起来。但是不知为何封印却被解开，瘴气向世界各地扩散着，有着魔女的遗传子的孩子们的魔力一起觉醒了…… 最高干部的魔女们，决定向各地的小学派遣特使。将世界各地的还未接触过魔法的孩子们集中起来，传授给他们在人间生存以及自卫的法术。持有魔女的遗传子的孩子们，被称为了次世代魔女，即魔法少女。
表面看来，江藤兰世（原荣里子 配音）只是一个普普通通的女孩子，可实际上，她出生在一个不得了的家庭之中。兰世的父亲望里（安原义人 配音）是一名吸血鬼，而母亲椎罗（小原乃梨子 配音）拥有着狼人的血统，这也就意味着，兰世既有可能继承父亲的血统成为一名吸血鬼，也可能成为狼女。只是血统的差异至今还没有在兰世的身上显现出来。兰世终于能够上学啦，在学校里，兰世遇见了名为真壁俊（水岛裕 配音）的男生，情窦初开的她瞬间坠入了情网。哪知道同班女生神谷曜子（富永美衣奈 配音）也一直暗恋着真壁俊，两个女生之间产生了激烈的竞争，兰世的特异能力亦在矛盾之中被激发了出来
片仓结平（藤田大助 配音）是一个个性开朗的高中三年级生，帅气的外表和作风让他在女生间有着极高的人气。某日，接到姐姐片仓铃子（远藤久美子 配音）的急电，匆匆赶回家的结平面前，矗立着一位面容娇俏的可爱女孩。女孩名叫坂下柚夜（黑葛原未有 配音），是结平的远房表妹，母亲的突然失踪让抚养柚夜的重任担负到了片仓一家的头上。 面对着突如其来的变故，结平感到不知所措，自己本来就还是一个贪玩的孩子，居然要去照顾另一个更加调皮和古灵精怪的妹妹。然而，随着了解的加深，结平发现，柚夜其实是一个非常善良和细腻的女孩，自己也开始思考起作为抚养人的责任和义务。每个人，都在挫折和失败中渐渐变得成熟和坚强起来。
