《铁探》讲述了督察尚垶（袁伟豪饰）原是警队明日之星，在一次行动中为救战友，不幸被匪徒一枪穿脑，经过抢救后奇迹生还，并且查案比以前更努力拼搏，赢得“铁探”的美誉。但尚垶饱受那次枪击的后遗症折磨，枪伤阴影、暴躁、甚至失禁。而总警司万晞华（惠英红饰）和Bingo（姜皓文饰）之间神秘的关系，也让那次枪击的真相扑朔迷离。在警队的大升迁年，尚垶被迫卷入了警界高层权力相争的漩涡中......
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘及见习医生曾淑淇的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生与急症科医生向众仁正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹的介入而面临一场情感考验。
为人聪明圆滑的韦小宝（陈小春）因义气帮助“反清复明”组织天地会击退清兵后，稀里胡涂接受该组织命令潜入宫中做了未净身的假太监，准备伺机偷取藏有清朝秘密的四十二章经。偶然结识微服的康熙皇帝（马浚伟）后，两人成为莫逆之交。
二十年前，武田國全偷看到父親贈送一捲軸給師弟剛正，國全認定捲軸裡面是「武道秘技」，後來剛正被逐出師門，更與空手道界斷絕往來。某日，新移民小玥被欺凌，準奧運空手道選手莊惠出手，被拉伕上馬的小混混志浩被捲入其中，剛正路過制止打鬥，豈料一眾鬧上警局...
