已过而立之年的肿瘤科医生冷云（陈小艺 饰）父母早亡，她独自抚养妹妹冷梅（焦俊艳 饰）长大，承担起姐姐和母亲的双重责任。如今的她生活安逸、波澜不惊，多年前的一场意外让她结识了正直善良的记者林易南（孙淳 饰），并最终走入婚姻的殿堂。丈夫对自己疼爱有加，妹妹也乖巧聪颖，不仅谋得一份理想的职业，也找到了自己心仪的恋人。但是平淡的生活骤起波澜，当年和冷云有着同样理想的同学兼恋人钟凯旋（蒋恺 饰）学成归国，并带着自己的研究成果——新型抗肿瘤药物A56加入了盛瑞制药。
明朝末年，武当派数位高手相继遇害。时隔多年，凶手仍然是个谜。当昔日遗孤——当俗家弟子耿玉京已长成翩翩少年时，与前来比武的东方亮不打不相识，成为了无话不谈的挚友。倏忽间，风云再起，先是泰昌帝服用武当红丸后暴毙，后是新任武当掌门又对耿玉京步步相逼。无奈之下，耿玉京离开了武当山，在“独行大盗”郑铁岗和其孙女郑巧儿的帮助下，秘密追查当年父母遇害的真相……在追查事情的过程中，他又先后遇到了少林僧人慧可、断魂谷谷主卢象升、昆仑西门燕等武林人士，最后还与辽东的努尔哈赤成为了忘年之交。当调查逐渐有了指向，昔年隐藏的真相逐渐显露端倪时，耿玉京终于发现了努尔哈赤鲸吞中原的野心，而自己的父母当初便是因此而被害。带着国仇和家恨，耿玉京、东方亮一行回到了武当，自此埋藏多年的谜案终于揭晓，内奸也受到了应有的惩罚。
该剧以中日甲午海战为背景,主人公不是历史上名声显要的人物,而是将关注的目光投向通过一群生活和战斗在“定远”舰上的水兵们,从小人物的角度反映出中华民族在大敌当前的危难时刻所表现出的无畏不惧,舍生取义的民族精神和爱国情操。
