本作为原创动画，将描绘游戏原作的遥远未来。故事以「グランシード学院」为舞台，以新世代的学生ネモ和ファリア两人为中心，讲述与不知名的「英雄」定下了契约的少年ネモ，在一次讨伐边境时与「グランシード学院」的学生会会长ファリア相遇，进而展开的原创故事。
果冤功失业，过上躺仄死涯的凶冈茂，有意间进进游戏天下。他舍弃内外，却换去了爆表的属性值，依附开挂般的能力，以 “相对神” 的身份开启第两人死。正在与同期进进游戏天下的圣华、诚司、丽兹三人配合冒险时，茂却背背着"触碰女人便会扣性命值"的致命瑕玷...为供自保，他本盘算尽快离队，径自应对游戏中的应战。然则失失落了伟年夜气力的他，第两人死究竟会怎样？！
线上游戏THE NEW GATE，因玩家数众多而热闹至极的虚拟世界突然发生剧变，将人们囚禁在游戏世界中，折磨着他们。为了打破这种痛苦的现状，身为游戏内最强玩家的一名青年——进决定挺身而出。阻挡在他面前的，是这个世界最强大的敌人“原初”。“结束了……！！！！”在殊死战的最后，进的一刀贯穿了“原初”的身体。回响的系统通知声宣告游戏破关，以及遭到囚禁的玩家们将获得解放。在人们一个个注销时，进也打算跟着向习以为常的世界告别，然而就在他注销的瞬间，崭新的大门突然开启——进受到光芒包覆后，映入他眼帘的竟是……游戏破关500年后的THE NEW GATE世界。身为最强玩家的青年将在变化为现实的游戏世界中，缔造出全新的传说。
在耶麻台国女皇选举的盛典中，人们都沉浸在热闹的氛围里，却没有料到危机的迫近······ 等到火的护卫（日魅子生父母，当时日魅子还是婴儿）向墨火祈祷和准备完毕后，众候选人在祭司的陪同下开始进入地下神殿。此时，依雅才发现大事不妙······正当选举进行时，突然传来了警报---狗根国以浮游要塞发动大规模袭击。城里顿时火海一遍。由于疏远防范，致使狗根国很快就控制了局势，形势不利下，依雅只能眼看着紫香乐进入地下神殿。 选举已经被打断，而紫香乐为了满足其父王的统一愿望，想将墨火抢走用来征服世界，并杀掉女皇后补们以除后患。出于保护意识，众候选人突然间被墨火传送到城的上空了，但在他们眼下的，是硝烟弥漫的耶麻台国······在地下神殿里，紫香乐为了知道将墨火转移的方法，以火魅子作威胁，为了保护日魅子的一与（火魅子之母）被紫香乐所杀。在得不到答复下火魅子被投向火焰中，但奇迹出现了，光包围着火魅子，在配合祭司们的咒语下，火魅子消失了······片刻之后，暗之泉涌出来了，发现了秘密的紫香乐奸险地笑了起来······另一方面，女皇后补们各自接受了不同的任务，向着自己的目的地出发了······ 清早上学的路上，碰到九峪的日魅子向他开了个玩笑，没想到弄得九峪尴尬不堪······在挖掘场里和姬岛的闲谈中，九峪不禁回想起与日魅子的初次相遇······ 下午，九峪在二人初遇的石阶上找到了正在面壁沉思的日魅子，在与她攀谈当时情景的时候，日魅子突然被光所包围，发觉和当时情景相似的九峪奋不顾身地也冲进光里，随后，二人消失了······
经历了惊心动魄的沙鲁之战，Z战士更新换代。地球在孙悟饭（野泽雅子 配音）和朋友们的守护下，迎来了七年漫长而又短暂的和平岁月。已变成俊朗青年的每天往返于学校，在此期间结识了撒旦的女儿比迪丽。伴随着全世界的呐喊，阔别已久的天下第一武道大会宣布再度召开。悟饭、比迪丽、18号悟天、特兰克斯甚至从另一个世界告假而来的孙悟空等Z战士高调参加比赛，令坐享其成的撒旦战栗不已。而在赛场上，两名奇怪选手的加盟则拉开了地球新一轮危机的帷幕。在此之后，来自外太空的邪恶魔法师巴菲迪登场，他利用邪恶手段复活了被界王神封印的恐怖对手魔人布欧（盐屋浩三 配音）。Z战士的最恶之战，地球危在旦夕……
