《待到山花烂漫时》以夏云、夏天和齐进南三人之间的感情戏为主线，通过对与夏云其它相关人物在不同时期的命运描写，反映了当今社会和军人特殊的价值取向，展现了新一代中国军人的励志精神及铸造当代军魂的心路历程。 本剧以描写我军从正规化到现代化建设的变革历程为背景，形象地表现了当代军人的崭新风貌和时代精神，是近年来创新表现军旅阴柔之气的言情剧， 堪称电视剧《士兵突击》的姊妹篇。该剧题材厚重大气、主题立意独到、人物设计新颖、故事催人泪下，是难得的怀旧、悬疑、悲情年代剧，展现了海峡两岸和平发展, 复兴中华民族大业的时代主题。
崔家药铺大小姐崔紫苏与县中富甲一方的段家银号之子段文彬青梅竹马，情投意合。
白素贞（孙骁骁 饰）是拥有千年道行的蛇妖，在观世音菩萨的指点之下来到人间，在那里，她邂逅了前世曾经救过自己的恩人许仙（路宏 饰），为了报答前世的恩情，白素贞以身相许，两人最终结为伉俪，共同经营着一家药铺。法海（张天阳 饰）被自己前世的一缕恶念所利用，见不得人和妖的结合，于是千方百计想要拆散白素贞和许仙两人。为了要挟白素贞，法海将许仙扣留在了金山寺中，为了救丈夫，白素贞和好姐妹小青（王沐暄 饰）不惜水漫金山，导致金山脚下的百姓们遭了临头大难。最终，白素贞不敌法海，被镇压在了雷峰塔之下，一晃眼就是几十年过去。
1935年，张翰涛为报父仇，假借抗日奇匪“杀八方”之名，在辽南海滨小城滨岛连续惩杀汉奸，却不料阴差阳错牵连出土匪、抗联、复兴社等多股隐藏势力，引来一场轩然大波。侦探出身的日寇宪兵老队长晴川为侦破“杀八方”案花费大量人力物力，在抽丝剥茧中逐渐发现张翰涛的重大嫌疑。张翰涛在与晴川及多股被牵势力的周旋中陷入绝境，本欲回归平民生活，却发现自己的报父仇行为已造成抗联成员、抗日土匪及无辜百姓惨遭日寇屠杀。张翰涛由此放下小我，誓要抵抗日寇为死难同胞报仇，在抗联情报站长张来财的舍身相救及继任站长王刚的扶持引领下，最终消灭了以晴川为首的滨岛日寇团体，并为抗联争取来一批重要的武器资源，成为民间抗日的传奇人物。
九·一八事变后，日本开始强化实施向满洲移民的政策。这一天是林口镇闻名遐迩的“正北货栈”的掌柜方振宇与吴萃花结婚的日子，宾客中有乔装而来的“梅姑寨子”的寨主吕金梅，还有日本在东北的组织“黑龙会”林口分会的会长松本太郎，松本太郎巴结方振宇提出与他结交，方振宇洞悉 “黑龙会”的企图，婉言拒绝。松本太郎借吕金梅杀害两个日本人的事件请求关东军援手，一队荷枪实弹的关东军扑向方家大院，方振宇和兄弟们寡不敌众，松本太郎威逼方振宇投靠“黑龙会”，方振宇痛斥日本人的强盗行径，松本太郎无奈举刀捅向方振宇。为给方振宇报仇，吴萃花投奔抗联积极参加抗日，之后重遇已经成为黑龙山首领的方振宇，吴萃花为了完成组织交代的任务，毅然跟随方振宇上黑龙山，成为黑龙山上智勇双全的“女响马”。
新城仁和医院，护士张淑梅被质疑用错药导致病人死亡被迫离开岗位，4岁女儿被人贩拐，张淑梅精神恍惚两年后被车祸夺去生命。美籍华裔外科专家庄恕为追查30年前母亲张淑梅的事故真相找寻走失的妹妹来到新城仁和医院。当年死者的女儿陆晨曦士师从傅博文成长为胸外科主治医生，却因反感利益为先屡次得罪胸外科主任扬帆被调至急诊。是庄恕屡次把技能过硬的陆晨曦重新带回胸外手术台。朝夕相处中，庄恕的医术让陆晨曦惊叹，对患者的周到考虑也让陆晨曦反思，二人渐生情愫，最终，庄恕找回了妹妹，也在陆晨曦的协助下还原了当年母亲当年事故的真相。
