在一次反恐行动中，由于情报失误，英国特警部队误杀了一名怀抱孩子的中东移民，负责行动队的首长决定将这宗丑闻彻底抹去，遂找来了知道真相的队员们统一口径，录制假口供。刑侦队长史蒂夫（马丁·康普斯顿 Martin Compston 饰）对于首长的决定十分不满，于是辞去了职务，被调往隶属于英国反贪署的秘密行动组。 史蒂夫的任务是调查一位名为托尼（连尼·詹姆斯 Lennie James 饰）的侦缉总督察，他因为涉嫌贪污而被列入了监视的名单。史蒂夫和女警探凯特（薇琪·麦克卢尔 Vicky McClure 饰）一同打入了托尼所领导的小组内部，史蒂夫却意外的发现，凯特还有另外一重秘密的身份。
谁也不曾想过，七十年前那期神秘的罗斯威尔事件，时至今日仍对全体人类产生着如此巨大的影响。并且鲜少有人窥见真相的全貌，即使它就在那里。某天，过着颓废生活的前联邦探员福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）以及他最为信赖的搭档——正在某某教会医院担任医师的丹娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）重新聚在一起。原来一档旨在揭露政治黑幕节目的主持人找到他们，希望二人披露政客利用外星人来控制人类的真相。以此为契机，关闭已久的X档案重新开启。一度对各种离奇事件失去信心的穆德，在斯科莉的陪伴下重新踏上征程。 而这一路上，层层隐藏起来的真相以及人类可怕的未来，将相继呈现在他们的眼前……
这座看似从未消失的小镇，如今却成为了新的卢尔德，吸引了大批游客。但一切或许并非表面那么美好。
本剧：缘起于Addison的重新开始，Addison的爱情之路仍让我们倍感纠结，希望她幸福的心从开始到最终未曾变过；双C终于走上了婚姻的殿堂，后面他们会有怎样的故事?
